O Plano de Ação Florianópolis Sustentável é resultado de um amplo trabalho de cooperação interinstitucional realizado no âmbito da Iniciativa Cidades Emergentes e Sustentáveis (ICES), promovido pelo Banco Interamericano de Desenvolvimento (BID) em parceria com a CAIXA. A Prefeitura de Florianópolis aderiu à iniciativa assumindo a coordenação local das atividades por meio de uma Comissão de Acompanhamento e Apoio à implementação da ICES no Município. O Instituto Brasileiro de Administração Municipal (IBAM) foi selecionado para a execução direta do trabalho junto à equipe da Prefeitura, sob a supervisão dos promotores. Outras instituições e empresas locais, nacionais e internacionais, parceiras da Iniciativa, também colaboraram em assuntos das suas especialidades.
Os temas de trabalho, agrupados nas três dimensões de sustentabilidade da ICES (ambiental, urbana e de governança e fiscal), foram abordados por especialistas a partir de estudos apoiados em indicadores, coleta de informações e por uma pesquisa de opinião pública realizada por uma empresa especializada local que registrou a percepção da população sobre os temas tratados.